Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
KRT82Q9NSB4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT82Q9NSB4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT82Q9NSB4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms