Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB6BQ9NRW1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB6BQ9NRW1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB6BQ9NRW1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms