Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NRIP3Q9NQ35 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.29■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NRIP3Q9NQ35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NRIP3Q9NQ35 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms