Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FANCFQ9NPI8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FANCFQ9NPI8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms