Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PNPLA8Q9NP80 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PNPLA8Q9NP80 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PNPLA8Q9NP80 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms