Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM60AQ9NP50 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM60AQ9NP50 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM60AQ9NP50 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM60AQ9NP50 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms