Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CD248Q9HCU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CD248Q9HCU0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CD248Q9HCU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms