Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
CLSPNQ9HAW4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.7■■■■□ 3.15
CLSPNQ9HAW4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CLSPNQ9HAW4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CLSPNQ9HAW4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms