Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8S5

CNTD2, Cyclin N-terminal domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTD2Q9H8S5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTD2Q9H8S5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTD2Q9H8S5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTD2Q9H8S5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTD2Q9H8S5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTD2Q9H8S5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CNTD2Q9H8S5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CNTD2Q9H8S5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CNTD2Q9H8S5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms