Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6I2

SOX17, Transcription factor SOX-17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17Q9H6I2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SOX17Q9H6I2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SOX17Q9H6I2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SOX17Q9H6I2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms