Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TAF1DQ9H5J8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TAF1DQ9H5J8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TAF1DQ9H5J8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
TAF1DQ9H5J8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms