Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4F8

SMOC1, SPARC-related modular calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOC1Q9H4F8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMOC1Q9H4F8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SMOC1Q9H4F8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SMOC1Q9H4F8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOC1Q9H4F8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SMOC1Q9H4F8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms