Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3W5

LRRN3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3Q9H3W5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRRN3Q9H3W5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRRN3Q9H3W5 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRRN3Q9H3W5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
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