Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
VCXQ9H320 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VCXQ9H320 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms