Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LINC00597Q9H2U6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LINC00597Q9H2U6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LINC00597Q9H2U6 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms