Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2E6

SEMA6A, Semaphorin-6A, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6AQ9H2E6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SEMA6AQ9H2E6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA6AQ9H2E6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA6AQ9H2E6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms