Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0T7

RAB17, Ras-related protein Rab-17, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB17Q9H0T7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB17Q9H0T7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAB17Q9H0T7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB17Q9H0T7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
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