Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MKRN2Q9H000 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MKRN2Q9H000 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MKRN2Q9H000 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms