Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

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Length 174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C20orf27Q9GZN8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C20orf27Q9GZN8 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C20orf27Q9GZN8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
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