Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN2

TGIF2, Homeobox protein TGIF2, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGIF2Q9GZN2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TGIF2Q9GZN2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TGIF2Q9GZN2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TGIF2Q9GZN2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TGIF2Q9GZN2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms