Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AMBRA1Q9C0C7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AMBRA1Q9C0C7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AMBRA1Q9C0C7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms