Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZCCHC2Q9C0B9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZCCHC2Q9C0B9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZCCHC2Q9C0B9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms