Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B2

CFAP74, Cilia- and flagella-associated protein 74, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP74Q9C0B2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
CFAP74Q9C0B2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
CFAP74Q9C0B2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
CFAP74Q9C0B2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CFAP74Q9C0B2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CFAP74Q9C0B2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms