Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
INO80BQ9C086 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
INO80BQ9C086 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
INO80BQ9C086 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms