Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXS4

TMEM59, Transmembrane protein 59, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM59Q9BXS4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM59Q9BXS4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TMEM59Q9BXS4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM59Q9BXS4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM59Q9BXS4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM59Q9BXS4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms