Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB11FIP5Q9BXF6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB11FIP5Q9BXF6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms