Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW7

SCRT1, Transcriptional repressor scratch 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT1Q9BWW7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SCRT1Q9BWW7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SCRT1Q9BWW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCRT1Q9BWW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms