Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWV2

SPATA9, Spermatogenesis-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA9Q9BWV2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SPATA9Q9BWV2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SPATA9Q9BWV2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SPATA9Q9BWV2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms