Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU79

TMEM243, Transmembrane protein 243, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM243Q9BU79 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEM243Q9BU79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM243Q9BU79 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms