Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MCMBPQ9BTE3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MCMBPQ9BTE3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MCMBPQ9BTE3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms