Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS2

RIOK1, Serine/threonine-protein kinase RIO1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK1Q9BRS2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
RIOK1Q9BRS2 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
RIOK1Q9BRS2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RIOK1Q9BRS2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RIOK1Q9BRS2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms