Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLX1AQ9BQ83 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SLX1AQ9BQ83 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SLX1AQ9BQ83 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms