Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPY8

HOPX, Homeodomain-only protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOPXQ9BPY8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOPXQ9BPY8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOPXQ9BPY8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOPXQ9BPY8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms