Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CITED1Q99966 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED1Q99966 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED1Q99966 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms