Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN18Q99952 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PTPN18Q99952 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPN18Q99952 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms