Protein–RNA interactions for Protein: Q99707

MTR, Methionine synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRQ99707 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRQ99707 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRQ99707 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRQ99707 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRQ99707 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTRQ99707 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTRQ99707 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTRQ99707 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRQ99707 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRQ99707 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRQ99707 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRQ99707 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRQ99707 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTRQ99707 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRQ99707 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRQ99707 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRQ99707 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRQ99707 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRQ99707 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRQ99707 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
MTRQ99707 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTRQ99707 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRQ99707 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRQ99707 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRQ99707 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTRQ99707 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRQ99707 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRQ99707 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRQ99707 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRQ99707 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRQ99707 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTRQ99707 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
MTRQ99707 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRQ99707 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRQ99707 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRQ99707 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRQ99707 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MTRQ99707 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRQ99707 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRQ99707 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRQ99707 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRQ99707 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRQ99707 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTRQ99707 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRQ99707 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRQ99707 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRQ99707 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRQ99707 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRQ99707 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTRQ99707 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTRQ99707 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MTRQ99707 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTRQ99707 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTRQ99707 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTRQ99707 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTRQ99707 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
MTRQ99707 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTRQ99707 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTRQ99707 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTRQ99707 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRQ99707 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRQ99707 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRQ99707 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRQ99707 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRQ99707 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRQ99707 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTRQ99707 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTRQ99707 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTRQ99707 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms