Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CGREF1Q99674 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CGREF1Q99674 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CGREF1Q99674 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms