Protein–RNA interactions for Protein: Q99624

SLC38A3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A3Q99624 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC38A3Q99624 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC38A3Q99624 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC38A3Q99624 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms