Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
SRPK1Q96SB4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SRPK1Q96SB4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SRPK1Q96SB4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms