Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UBL7Q96S82 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
UBL7Q96S82 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBL7Q96S82 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms