Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CTAGE1Q96RT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTAGE1Q96RT6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CTAGE1Q96RT6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTAGE1Q96RT6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms