Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RAB3IPQ96QF0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAB3IPQ96QF0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
RAB3IPQ96QF0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3IPQ96QF0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms