Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COG8Q96MW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
COG8Q96MW5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COG8Q96MW5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms