Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
YTHDC1Q96MU7 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
YTHDC1Q96MU7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
YTHDC1Q96MU7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
YTHDC1Q96MU7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 679.1 ms