Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ROBO3Q96MS0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ROBO3Q96MS0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ROBO3Q96MS0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ROBO3Q96MS0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms