Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PCMTD1Q96MG8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PCMTD1Q96MG8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PCMTD1Q96MG8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms