Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD2

C12orf66, KICSTOR complex protein C12orf66, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf66Q96MD2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C12orf66Q96MD2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C12orf66Q96MD2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C12orf66Q96MD2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
C12orf66Q96MD2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf66Q96MD2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf66Q96MD2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C12orf66Q96MD2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms