Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LINC00615Q96LM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
LINC00615Q96LM1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LINC00615Q96LM1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms