Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFRQ96KR1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZFRQ96KR1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZFRQ96KR1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms