Protein–RNA interactions for Protein: Q96KG9

SCYL1, N-terminal kinase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL1Q96KG9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCYL1Q96KG9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCYL1Q96KG9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCYL1Q96KG9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCYL1Q96KG9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCYL1Q96KG9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCYL1Q96KG9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCYL1Q96KG9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCYL1Q96KG9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms